神族见人间一片生灵涂炭，便只好插手，将九件神器一同封印，并教人戒除这九种恶念，这样鬼灵精怪自然不会生出，但凡人并不能完全戒除，故鬼灵精怪亦时有出没。经过诛神之战同封印神器，神族势力大为衰退，故开始从人族中挑选一些能戒除恶念之人传授神力，是为仙。

此时仅余天帝，西王母，上神长渊，日神，月神，星神，云书同一些上神，又过了万年时光，众神皆当历劫重生，而魔妖两族竟在此时出现了两位法力极高的魔和妖，一举统领了魔妖两界，自封为魔君，妖王，并再次发起了诛神之战，即二次诛神之战。

此时虽有仙君抵挡，但因众神历劫，妖魔二族迅速占领人神两界，这一战，神族一败涂地。神族虽败但并未投降，众神聚集起来商议对策，后得知妖魔二族能迅速强大皆因魔君，妖王的强大法力，其实二族内部势力错综复杂，结盟不稳。

于是定下计策，由日神与长渊上神去单挑魔君与妖王，其他众神及仙君随天帝指挥攻打妖魔两族。那一战，亦是打得天昏地暗，兵分两路，各自进行，是为天地间之大浩劫。果然由于妖魔两族中各自为政，一击即散，溃不成军，天帝一行大获全胜。

而另一边长渊上神同妖王战的亦是难分高下，后终于上神将妖王打败，将其斩于不周山，但上神亦受重伤，此时云书依旧一直跟在上神身边，上神打败妖王便立刻前去帮助日神，日神此时已同魔君处于胶着之时，魔君见上神赶来，知妖王已败，于是便打算与日神同归于尽。

魔君将自己的全部精元以自我毁灭的方式冲入日神身体中，日神无法承载魔君的巨大能量，于是化为原形并且膨胀了十倍，挂于天空，整个人间陷入一片炙烤中，为了将魔君彻底消灭，也为了解救受炙烤之苦的万物，云书将自己化成原形保护着上神长渊将魔君封印于日落西沉之地——沉渊之中，封印之后云书身毁神散，化成满天云朵，随风消散，而长渊上神也因伤重沉睡于北海之极。

这一战，神，仙，妖，魔，人五界皆受重创，亡魂众多，形成鬼界，因此天帝重新主持六界，修订神职仙规人法，划分妖界魔域鬼地，从此六界各行其道，各司其职，重新建立天地秩序，从此上古时代结束，进入新纪元。

而长渊上神在北海沉睡不知多久，直到五千年前才醒来，重新飞升，只是飞身之后除神力依旧之外，记忆却全无了。云书虽形毁神散，但所幸云书本为始祖盘古之灵气，故能历千万年而不灭，虽神毁但灵在，历经数万年也终将灵聚成，化出身形，修为仙，为织云仙子，记忆全无，后历经数千年，上神同云书再无相见。而且天帝将上古史中关于云书的内容全部抹去，这原因却是不知，故知云书来历者仅二三上神。而今又到众神皆历劫之时，因此，天地间恐又将有一番动荡。

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